La collezione Ninni-Marella di manufatti e modelli di imbarcazioni e strumenti da pesca comprende oltre 200 pezzi che illustrano i sistemi di pesca in uso nella Laguna di Venezia nella seconda metà del 1800; è accompagnata da didascalie che riportano anche i nomi dialettali e da una raccolta di acquerelli originali a colori illustranti le vele delle imbarcazioni da pesca. 

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La collezione Giovanni Miani fu ceduta dallo stesso al Municipio di Venezia nel 1862; consisteva nei materiali etnologici da lui raccolti nel corso della sua prima spedizione alla ricerca delle sorgenti del Nilo (1859-60), accompagnati dai manoscritti, dai disegni originali e dal suo diario autografo. 

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La collezione Giuseppe De Reali consta di trofei venatori (esemplari naturalizzati, pelli, busti, corna), oggetti in legno, metallo, pelle e fibre, oltre che di numerose fotografie originali d’epoca; i materiali sono stati raccolti tra il 1898 e il 1929 durante le spedizioni di “caccia grossa” compiute nell’Africa orientale ed equatoriale.

La collezione Napoleone Forin è formata da reperti etnografici e zoologici raccolti in Somalia tra il 1959 e il 1974; si tratta soprattutto di trofei di mammiferi e di armi e attrezzi per la caccia. 

La collezione Giancarlo Ligabue include reperti di tipologia molto varia, tanto da essere stata suddivisa tra le sezioni di paleontologia, paleoantropologia ed etnologia. I materiali sono stati raccolti o acquistati da Giancarlo Ligabue nel corso di numerose spedizioni scientifiche in diverse regioni del mondo